Johannieter Orde

Na deze periode kwam Malta achtereenvolgens in het bezit van Rogier de Normandiër I en II en de huizen van de Hohenstaufen, Anjou, Barcelona, Aragon en, door de vereniging van Aragon met Castilië in 1479, het Spaanse Rijk. Om tegenwicht te bieden aan de Turkse bedreiging van katholiek Europa stond de Spaanse koning Karel V in 1530 Malta af aan de Johannieter Ridders of Maltezer Orde, waarmee een zeer belangrijke periode in de Maltese geschiedenis werd ingeluid. De hospitaalridders vestigden zich in Birgu, aan de grote natuurlijke haven waarin de vloot werd ondergebracht, en bouwden vervolgens Senglea en Bormla. Na de bijna succesvolle belegering door 40.000 Turken in 1565 werd begonnen met de bouw van Valletta, genoemd naar de toenmalige grootmeester Jean Parisot de la Valette. Ook Medina werd door de ridders herbouwd. Uit deze tijd dateren onder meer de vestingwerken van Valletta, Floriana, de 'Drie Steden' en Medina, het rechthoekige stratenpatroon van Valletta, de auberges en kapellen in Valletta van de verschillende langues in de orde, de bedrieglijke bochten en hoeken in de straten en de paleizen in Medina, en de kathedraal in Valletta waar het beroemde schilderij 'De Onthoofding van St. Johannes de Doper' van de Italiaanse schilder Caravaggio te bezichtigen is.